估计阅读时长: 5 分钟 https://github.com/xieguigang/scale_colour_genshin 在用R绘图时,颜色设置是美化过程中不可缺少的一步。在实际绘图时,一般不会一一手动寻找合适的颜色,而是通过一些R包、网站提供好的,美观的颜色组合,即调色板(palette),可供使用。在这里介绍一种通过提取图片主题色的方法来为我们自动生成画图所用的颜色板数据。 Order by Date Name Attachments 383807b4 • 132 kB • 73 click 08.04.2023faruzan • […]
估计阅读时长: 9 分钟 因为一种单一的编程语言并不会覆盖到所有的适用场景的原因,在一个软件工程项目之中,采用多种语言进行混合编程是一种很常见的协作方式。例如,脚本化的语言,其非常适合于进行最顶层的应用开发,就像胶水一样用于将各种组件进行粘贴,但是脚本化的语言自身因为是基于其他的语言所构建,所以执行效率一般不会太好。对于底层组件,我们一般就会需要使用静态编译类型的非托管语言创建用于高性能数据处理的模块。对于这种需求的底层模块,我们一般可以采用C/C++/Rust来编写。 Order by Date Name Attachments rust • 162 kB • 74 click 25.03.2023dyn-load • 67 […]
估计阅读时长: 8 分钟 https://github.com/rsharp-lang/NRRD NRRD(Nearly Raw Raster Data)是一种用于存储类似于热图成像数据的文件格式。其实我们可以将NRRD看作为类似于bitmap之类的未压缩的原始光栅图像文件。只要我们有对应的解码方式,我们就可以像查看普通图片文件一样查看NRRD文件。 Order by Date Name Attachments raster__238 • 61 kB • 72 […]
估计阅读时长: 5 分钟 在BILIBILI上观看视频:《【BioNovoGene Mzkit教程】代谢组学原始数据处理基础》 最近我在B站的视频页面下发现了这样的一条评论,面对质谱数据分析领域内的初学者的求教,其实自己也是非常的诚惶诚恐的。因为在视频中所使用的脚本语言是自己开发的一门新语言,所以可能给一些初学者造成了一部分的困扰哈哈😅😄😅😅。首先先对这个粉丝说一声抱歉哈。 针对上述的提问,我的回答大概是有以下的几点: Order by Date Name Attachments question_20230223 • 17 kB • 72 click […]
Figure 3. MetaMapp of the metabolic modules that were altered in E. coli grown in galactose.
估计阅读时长: 5 分钟 在工作之中可能会遇到需要进行两个网络图对象之间的相似度计算的情形:例如在质谱数据分析的化学信息学计算工作之中,我们在解析SMILES字符串得到分子图之后,可以基于图相似度比较计算方法来比较计算两个代谢物分子图之间的结构上的相似度。 Attachments pone.0078360.g003 • 2 MB • 118 click 06.08.2022https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0078360
估计阅读时长: 31 分钟 Like the original R language it does, the R# system just provides a runtime to running […]
估计阅读时长: 69 分钟 Read on CodeProject: https://www.codeproject.com/Articles/5338916/Introducing-Rsharp-language With many years of do scientific computing works by VB.NET language, I'm […]
估计阅读时长: 7 分钟 https://github.com/rsharp-lang/ggplot 在进行复杂关系的数据集进行可视化的时候,通过网络图的方式进行数据可视化可以让我们非常直观的借助于网络节点的聚集程度之类的布局信息了解到我们的复杂数据的关系结构信息。最近将R#语言之中的ggplot包进行网络可视化的代码库进行了一些更新。基于此功能更新工作,目前在ggplot程序包之中成功集成了ggraph程序包类似的网络可视化功能。在这里做了一些总结分享给大家。 Order by Date Name Attachments enrichNetwork_ggraph • 70 kB • 132 click 01.06.2022enrichNetwork_ggraph2 • […]
估计阅读时长: 14 分钟 https://github.com/rsharp-lang/ggplot 在完成了前面所提到的ANOVA检验模块的代码开发编写工作之后,之前一直悬在我心里面的完善R#语言的ggplot统计作图功能的愿望现在终于实现了。在R#语言之中通过使用ggplot代码库进行相应的数据统计分析作图,目前已经变得和R语言之中的ggplot2程序包那样同样的简单和漂亮。 Order by Date Name Attachments myeloma_bar • 196 kB • 175 click 29.05.2022myeloma_box • […]
估计阅读时长: 14 分钟 一般而言,如果我们在进行组学数据分析的时候,如果想要比较两组数据之间是否存在有差异性,一般是对两两比较的两组数据进行T-检验。但是在代谢组学数据分析领域内,则很多的组学数据分析情况为比较两组以上的数据,寻找差异的biomarker。那这个时候就需要使用上ANOVA统计检验方法了。 Order by Date Name Attachments anova • 105 kB • 238 click 28.05.2022ANOVA-screen • 27 […]
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  1. 空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗?我试了试,不是10X结果中的tissue_positions_list.csv(软件选择此文件,直接error);在默认结果中也没找到类似的文件;