我是一位国产工业软件开发者

Mzkit桌面工作站

Mzkit工作站软件主要是应用于基于核磁共振/质谱数据的化学信息学方面的CAE(计算机辅助工程与计算机辅助分析)数据分析功能。目前已完成对质谱数据以及NMR数据的支持。目前的研发投入主要集中在质谱成像相关功能以及定量计算分析等分析化学相关的功能研发。 Mzkit目前为一款诺米代谢向大家所提供的免费开源的质谱数据分析软件

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我目前所从事的工作是在国内的一家比较大的代谢组学服务公司的高级数据科学家,主要从事一些使用VisualBasic.NET,R/R#语言进行数据科学相关的分析脚本以及流程编写开发工作。如果你对我自己模仿R语言所创建的R#语言做数据分析感兴趣的话,我这个博客网站目前是你进行R#语言学习的最好选择。
估计阅读时长: 6 分钟 https://github.com/rsharp-lang/NRRD NRRD(Nearly Raw Raster Data)是一种用于存储类似于热图成像数据的文件格式。其实我们可以将NRRD看作为类似于bitmap之类的未压缩的原始光栅图像文件。只要我们有对应的解码方式,我们就可以像查看普通图片文件一样查看NRRD文件。 Order by Date Name Attachments raster__238 • 61 kB • 8 click 10.03.2023nrrd_text • 45 […]
估计阅读时长: 3 分钟 在BILIBILI上观看视频:《【BioNovoGene Mzkit教程】代谢组学原始数据处理基础》 最近我在B站的视频页面下发现了这样的一条评论,面对质谱数据分析领域内的初学者的求教,其实自己也是非常的诚惶诚恐的。因为在视频中所使用的脚本语言是自己开发的一门新语言,所以可能给一些初学者造成了一部分的困扰哈哈😅😄😅😅。首先先对这个粉丝说一声抱歉哈。 针对上述的提问,我的回答大概是有以下的几点: Order by Date Name Attachments question_20230223 • 17 kB • 13 click 24.02.2023open_Rdevtool • 162 kB […]
Figure 3. MetaMapp of the metabolic modules that were altered in E. coli grown in galactose.
估计阅读时长: 3 分钟 在工作之中可能会遇到需要进行两个网络图对象之间的相似度计算的情形:例如在质谱数据分析的化学信息学计算工作之中,我们在解析SMILES字符串得到分子图之后,可以基于图相似度比较计算方法来比较计算两个代谢物分子图之间的结构上的相似度。 Attachments pone.0078360.g003 • 2 MB • 57 click 06.08.2022https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0078360

关于创作者

R#语言之父,热衷于各种数据可视化。在代谢组学数据分析和机器学习领域内有着非常丰富的工作经验,大约10年的生物信息学研发工作经验。平时最开心的时候就是可以在工作中重复造各种轮子,并且可以成功的应用于各种商业化项目之中。经过多年的生物信息学和化学信息学领域内的工作,目前手头上已经重复造出了非常多的轮子,积累了大量的代码库,对各种数据分析方法轮子的使用也都非常得心应手。

诺米代谢BioDeep研发中心

谢桂纲 · 高级数据科学家
目前主要从事代谢组学领域内的数据分析方法开发,化学信息学质谱数据分析以及质谱应用研发,生物信息学大数据挖掘,工业软件研发相关的工作。