估计阅读时长: 9 分钟因为一种单一的编程语言并不会覆盖到所有的适用场景的原因,在一个软件工程项目之中,采用多种语言进行混合编程是一种很常见的协作方式。例如,脚本化的语言,其非常适合于进行最顶层的应用开发,就像胶水一样用于将各种组件进行粘贴,但是脚本化的语言自身因为是基于其他的语言所构建,所以执行效率一般不会太好。对于底层组件,我们一般就会需要使用静态编译类型的非托管语言创建用于高性能数据处理的模块。对于这种需求的底层模块,我们一般可以采用C/C++/Rust来编写。
估计阅读时长: 2 分钟https://github.com/dotvanilla/vanilla 在Vanilla编译器项目之中,会需要一个程序模块将VisualBasic代码进行解析为语法树。然后我们基于此语法树就可以将VisualBasic项目转换为WAST源代码,从而实现编译为WebAssembly程序了。在这个步骤之中,我们可以通过一个微软官方的Roslyn编译器平台来实现。
估计阅读时长: 9 分钟https://github.com/dotvanilla/vanilla WebAssembly是一种运行在浏览器端的二进制程序集文件。和普通的应用程序开发一样,WebAssembly需要基于一定的源代码文本进行编译。这个编译所需要的源代码文本就是WAST文件。 Understanding WebAssembly text format(https://developer.mozilla.org/en-US/docs/WebAssembly/Understanding_the_text_format)
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/rsharp-lang/R-sharp 今天在这里给大家介绍的是一些在R#脚本语言编程之中的一些高级语法,关于R#语言的一些基础语法,大家可以阅读R#语言教程系列的第一篇《R#语言简明教程》 对于R#脚本与R脚本语言之间的关系,大家可以将R#语言看作为R语言的一个超集,相似于TypeScript语言与JavaScript语言之间的关系。在这篇文章中,我主要向大家介绍在R#语言之中针对R语言的一些不足进行的改进部分。
估计阅读时长: 8 分钟https://github.com/rsharp-lang/R-sharp R#语言的语法主要来自于R语言,其在保留了很多的R语言特性的同时,也添加了很多新语法特性。对于R#与R语言之间相同的语法特性,在本简明教程中我就不再叙述了,在这里主要是给大家说明一下R#语言相对于R语言新增的一些语法特性。 R#语言中的向量 R#语言任然保持着和其前辈R语言一样的向量化编程的特性。对于声明一个向量,在R语言之中,需要使用c函数进行申明,而对于R#语言而言,除了使用c函数,还可以直接使用方括号进行申明,例如: x = c("A","B","C") # x # [1] "A" "B" "C" x = […]
估计阅读时长: < 1 分钟https://github.com/rsharp-lang/R-sharp R#语言最开始的开发需求来自于对GCModeller的组件的调用需求。因为最开始GCModeller使用的是命令行模式进行运行,但是因为VB.NET语言为编译型语言,所开发的应用程序在发布之后,用户无法轻易的修改。自己对于一些比较个性化的数据分析,在引入R#语言之前,需要专门编写一段命令行代码跑GCModeller,会十分的不方便。所以后面就有了R#脚本语言的开发。 R#语言类似于R或者Matlab语言,也是一种向量化的编程脚本语言。其语法源自于R语言,同时也结合了一些TypeScript的语法,例如TypeScript之中的字符串插值语法就被引入了R#语言之中。 const words = ["world", "R# language", "GCModeller User"]; const hello = `hello ${words}!`;

代谢组学那堆名词我上次查资料时也手抄过一页,QC 样本、保留时间、m/z 这些混在一张表里,来回对照着看特别费劲。你这篇把英文缩写和中文解释排在一起,省了我不少翻文献的功夫,尤其是代谢物鉴定那几段。
文中提出的"能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢?"让我想到一个需要先厘清的问题:把Family层级的分类当作细胞分群标签时,功能相似性与亲缘关系可能会混在一起,图上的聚集未必能直接解释为代谢功能接近。如果借用单细胞分析中的降维流程,是否可以同时标注物种分类和基因组注释完整度,看看分离主要对应哪一种差异?尤其是这里用的是EC注释的TF-IDF矩阵,缺少某项注释究竟代表功能缺失还是未被识别,也可能影响对分群结果的判断。
这个角度之前没想到,零分布原理及其在生物信息学中的应用 确实值得深入了解。刚好之前看过,可以对照着看看。
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