https://github.com/rsharp-lang/ggplot 在生物信息学中的组学数据分析领域内,有一个非常常见的数据可视化图表:应用于可视化两两组别比对结果的火山图。在火山图之中,X坐标轴一般是log2FC,纵坐标Y轴,则一般是t检验的pvalue的-log10转换之后的值。由于fold change有大于1的值,A/B大于1,表示A的表达量高于B的表达量,反之小于一表示A的表达量低于B的表达量。这样子fold change经过log2转换之后,就会出现负数,散点一般呈轴对称分布在X=0的位置周围。这样子绘制出来的散点图就有点类似于火山喷发的样子了。 Order by Date Name Attachments a679af1eb9ffbfbad48c18d563ea51f3 • 45 kB • 61 click […]
https://github.com/xieguigang/sciBASIC/tree/master/gr/Microsoft.VisualBasic.Imaging/Drawing3D 因为大家大多数都是从小接受电子游戏,所以长大了之后能够自己从零开始开发一个完整的3维图形引擎是每一个男程序员的梦想。这个就像玩机械的男人的梦想就是自己从头开始组装一辆汽车。还好这个梦想我在几年前就已经实现了。 Order by Date Name Attachments Cube3D_VB.NET • 4 MB • 36 click 19.09.2021Cube_screenshot • […]
https://github.com/dotvanilla/vanilla 在Vanilla编译器项目之中,会需要一个程序模块将VisualBasic代码进行解析为语法树。然后我们基于此语法树就可以将VisualBasic项目转换为WAST源代码,从而实现编译为WebAssembly程序了。在这个步骤之中,我们可以通过一个微软官方的Roslyn编译器平台来实现。 Order by Date Name Attachments Roslyn-nuget • 107 kB • 39 click 24.07.2021what-is-visual-studio • […]
https://github.com/biocad-cloud/web HTTP协议(Hypertext Transfer Protocol)是建立在TCP协议基础上的一种文件传输协议。 Order by Date Name Attachments https-secure-webpages_waifu2x_art_noise3_scale_tta_1 • 770 kB • 35 click […]
Computational Analysis of Biochemical Systems
今天在这里和大家聊一下《生物化学系统的计算分析》这本书,生物化学系统的计算分析这本书可以说得上是我的生物信息学学习生涯的启蒙书。 Order by Date Name Attachments Computational Analysis of Biochemical Systems • 875 kB • 35 […]
https://github.com/xieguigang/sciBASIC 在分布式哈希表网络之中,Peer节点之间进行分布式数据传输都是使用的B编码。B编码格式与JSON编码格式较为相似,均以“键:值”形式存储,我们可以将B编码的字符串整个内容理解为一个经过特殊编码的字典,或者一个近似的JSON。B编码与JSON编码,这两种编码都仅包含有4种最基础的数据类型:字符串类型,数值类型,数组类型与对象字典类型。 Order by Date Name Attachments DHT-dark-all • 416 kB • 34 click 04.06.2021bdecode • […]
https://github.com/xieguigang/sciBASIC 根据积分表达式,微分方程的数值解关键在于微分方程的初值及计算微分方程式在tm(上一时刻)与tm+d(下一时刻)与坐标轴围成面积,若这个面积计算得越准确则得到的数值解也就越精确。微分表达式中与坐标轴围成的面积可表示如下,在实施算法的时候可以结合这个图更加直观点: 从上面的示意图可以看出,一段需要进行面积积分的曲线实际上是由多个梯形构成的多边形。那我们实际上只需要将这些梯形的面积都求出来,然后加起来就好了。 这里的梯形分割就是一种欧拉逼近的思想,欧拉逼近的几何意义,就是我们可以使用一段折线来近似的逼近一条曲线。 利用欧拉逼近,我们可以将一个精确的微分方程曲线 近似的使用线段来表示 Order by Date Name Attachments ODE_Trapezoidal • 30 kB • […]
https://github.com/xieguigang/linux-profiler 废话不多说,首先给出一个 demo报告链接 给大家看看这个小工具的成品输出。 在去年的工作中,因为公司需要购买新的服务器做集群计算,需要一个工具来记录之前的服务器在数据分析上的性能瓶颈。于是花了两天的时间赶出来了这个专门应用于Linux系统的性能记录工具。这个小工具是一个开源项目,大家可以在Github上阅读这个开源项目(linux-profiler)的源代码。 Order by Date Name Attachments systemLoad • 53 kB • 37 […]
https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序,由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大,所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中,分为两种模式:线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式,我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考: 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
在BILIBILI上观看视频:《【GCModeller教程】KEGG代谢途径注释原理 (重置版)》 Order by Date Name Attachments kegg_annotation • 468 kB • 40 click 30.05.2021release.mp4_20190921_225235.396 • […]
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