估计阅读时长: 8 分钟 https://github.com/rsharp-lang/R-sharp 对于0,1两类分类问题,一些分类器得到的结果往往不是0,1这样的标签。如神经网络得到诸如0.5,0.8这样的分类结果。这时,我们人为取一个阈值,比如0.4,那么小于0.4的归为0类,大于等于0.4的归为1类,可以得到一个分类结果。同样,这个阈值我们可以取0.1或0.2等等。 Order by Date Name Attachments ROC • 221 kB • 201 click 28.06.2021Roccurves • […]
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估计阅读时长: 23 分钟 https://github.com/rsharp-lang/R-sharp 降维是将数据由高维约减到低维的过程而用来揭示数据的本质低维结构。它作为克服“维数灾难”的途径在这些相关领域中扮演着重要的角色。在过去的几十年里,有大量的降维方法被不断地提出并被深入研究,其中常用的包括传统的降维算法如PCA和MDS;流形学习算法如UMAP、t-SNE、ISOMAP、LE以及LTSA等。 Order by Date Name Attachments MNIST-LabelledVectorArray-60000x100 • 230 kB • 217 click 27.06.2021MNIST-LabelledVectorArray-60000x100Euclidean_Distance • […]
估计阅读时长: 11 分钟 https://github.com/SMRUCC/GCModeller 在R语言之中,存在着一个用于进行表达数据的时间序列分析的程序包:TCseq。TCseq的全称为Time course sequencing,即时间序列分析,通过对表达矩阵进行时间上的模糊CMeans聚类,得到表达变化趋势一致的基因列表,进行基因表达的时间趋势分析。 在GCModeller之中,我仿照着TCseq程序包,自己编写了一个时间序列的聚类与可视化分析的R#程序包模块,在这里介绍给大家。 Order by Date Name Attachments Gene expression pattern visualization • 2 […]
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  1. 针对图对象进行向量化表示嵌入: 首先,通过node2vec方法,将node表示为向量 第二步,针对node向量矩阵,进行umap降维计算,对node进行排序,生成node排序序列 第三步,针对node排序序列进行SGT序列图嵌入,实现将网络图对象嵌入为一维向量