估计阅读时长: 15 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism NetCDF文件格式(Network Common Data Format)是一种以network byteorder进行编码的CDF数据文件格式。其广泛应用于大气科学、水文、海洋学、环境模拟、地球物理等诸多数据科学计算分析领域内的数据存储。 Order by Date Name Attachments netcdf • 2 MB • […]
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估计阅读时长: 11 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism LINQ(Language Integrated Query)技术是一种语言集成查询,即LINQ是VisualBasic语言之中的一种语法。其由微软公司于.NET Framework 3.5引入的一种SQL查询语言非常相似的数据查询语法。 Order by Date Name Attachments query • 51 kB • […]
估计阅读时长: 5 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序,由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大,所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中,分为两种模式:线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式,我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考: 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
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  1. 空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗?我试了试,不是10X结果中的tissue_positions_list.csv(软件选择此文件,直接error);在默认结果中也没找到类似的文件;

  2. 目前软件上提供了用于手动关联空间转录组数据和空间代谢组数据的功能,使用具体的功能可以通过成像画布上通过右键菜单依次打开【Samples】->【Add Spatial Tile】加载Space Ranger的空间斑点结果:在软件上进行手动旋转调整位置完成两个空间组学之间的空间位置关联,然后老师这边拿到空间位置关联信息后,就可以按照斑点的空间位置对应关系导出表达数据做关联分析了