估计阅读时长: 10 分钟 https://gcmodeller.org/ 流平衡分析(flux balance analysis)是一种可以用来构建和模拟分析基因组级别的代谢网络的数学方法。流平衡分析是系统生物学(system biology)的一个重要的分析手段。不同于以湿实验的代谢通量分析(metabolic flux analysis, MFA),FBA是用数学方法对代谢网络里的代谢流进行拟合分析。 Order by Date Name Attachments Electron micrographs of […]
估计阅读时长: 9 分钟 https://github.com/rsharp-lang/bing-academic 必应学术是由微软必应团队联合微软研究院打造的免费学术搜索产品。旨在为广大研究人员提供海量的学术资源,并提供智能的语义搜索服务。目前已涵盖多学科学术论文、国际会议、权威期刊、知名学者等方面。搜索位置:http://cn.bing.com/academic。 Order by Date Name Attachments Bing_Logo • 14 kB • 137 click 14.08.2021html-compression • […]
估计阅读时长: 9 分钟 https://github.com/xieguigang/sciBASIC 应用程序管线模式就是我们将执行时间比较长,计算任务比较重量级的代码放到一个新的子进程之中执行。通过子进程进行任务执行的应用程序管线模式在各个操作系统上的大型应用程序中都会涉及到。 Order by Date Name Attachments processexplorer • 206 kB • 140 click 26.06.2021vs_pipeline • […]
估计阅读时长: 5 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序,由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大,所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中,分为两种模式:线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式,我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考: 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
waiting and waiting.
Cool + for the post
老师提到的这个问题,我这几天会写一个使用教程,老师后面可以用教程中对应的demo示例来了解下功能的使用
空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗?我试了试,不是10X结果中的tissue_positions_list.csv(软件选择此文件,直接error);在默认结果中也没找到类似的文件;
目前软件上提供了用于手动关联空间转录组数据和空间代谢组数据的功能,使用具体的功能可以通过成像画布上通过右键菜单依次打开【Samples】->【Add Spatial Tile】加载Space Ranger的空间斑点结果:在软件上进行手动旋转调整位置完成两个空间组学之间的空间位置关联,然后老师这边拿到空间位置关联信息后,就可以按照斑点的空间位置对应关系导出表达数据做关联分析了