估计阅读时长: 16 分钟 https://github.com/xieguigang/sciBASIC 等高线指的是地形图上高程相等的相邻各点所连成的闭合曲线。把地面上海拔高度相同的点连成的闭合曲线,并垂直投影到一个水平面上,并按比例缩绘在图纸上,就得到等高线。 Order by Date Name Attachments 1_Contour • 487 kB • 174 click 30.06.2021Ms1Contour • […]
估计阅读时长: 8 分钟 https://github.com/rsharp-lang/R-sharp 对于0,1两类分类问题,一些分类器得到的结果往往不是0,1这样的标签。如神经网络得到诸如0.5,0.8这样的分类结果。这时,我们人为取一个阈值,比如0.4,那么小于0.4的归为0类,大于等于0.4的归为1类,可以得到一个分类结果。同样,这个阈值我们可以取0.1或0.2等等。 Order by Date Name Attachments ROC • 221 kB • 204 click 28.06.2021Roccurves • […]
MNIST-LabelledVectorArray-60000x100
估计阅读时长: 23 分钟 https://github.com/rsharp-lang/R-sharp 降维是将数据由高维约减到低维的过程而用来揭示数据的本质低维结构。它作为克服“维数灾难”的途径在这些相关领域中扮演着重要的角色。在过去的几十年里,有大量的降维方法被不断地提出并被深入研究,其中常用的包括传统的降维算法如PCA和MDS;流形学习算法如UMAP、t-SNE、ISOMAP、LE以及LTSA等。 Order by Date Name Attachments MNIST-LabelledVectorArray-60000x100 • 230 kB • 222 click 27.06.2021MNIST-LabelledVectorArray-60000x100Euclidean_Distance • […]
MS-Imaging in mzkit software
估计阅读时长: 3 分钟 http://mzkit.org/ 质谱成像是以质谱技术为基础的成像方法,该方法通过质谱直接扫描生物样品成像,可以在同一张组织切片或组织芯片上同时分析数百种分子的空间分布特征。 Order by Date Name Attachments HR2MSI mouse urinary bladder S096 - optical image • […]
估计阅读时长: 13 分钟 https://github.com/xieguigang/voyager-1 旅行者一号是一艘由NASA在1977年9月5日发射的宇宙飞船,其只比旅行者2号晚16天发射。旅行者一号除了担负着研究我们的太阳系的任务之外,在这艘飞船之上还搭载着一张我们尝试对外界介绍我们的文明的一张名片为“地球之音”的铜质镀金激光唱片,这张金唱片承载着人类与宇宙星系沟通的使命。 Order by Date Name Attachments 1080px-The_Sounds_of_Earth_Record_Cover_-_GPN-2000-001978 • 330 kB • 199 click 18.06.2021scripting • […]
估计阅读时长: 7 分钟 https://github.com/xieguigang/mzkit SMILES字符串是一种在计算化学领域内使用线性ASCII字符串描述一个具有空间立体结构的分子结构所使用的一种语言规范。因为在工作中会需要使用到SMILES字符串做一些分子结构相关的数据建模分析,所以编写了一个很方便的用于SMILES字符串解析操作的模块,在这篇文章中为大家讲解具体的工作原理。 Order by Date Name Attachments science-connection-structure-with-molecules-simple-modern-white-background-illustration_46577-719 • 36 kB • 200 click 09.06.2021abstract-molecules-structure-with-connect-spherical-particles_46577-689 • […]
Computational Analysis of Biochemical Systems
估计阅读时长: 6 分钟 今天在这里和大家聊一下《生物化学系统的计算分析》这本书,生物化学系统的计算分析这本书可以说得上是我的生物信息学学习生涯的启蒙书。 Order by Date Name Attachments Computational Analysis of Biochemical Systems • 875 kB • 164 […]
估计阅读时长: 7 分钟 https://github.com/xieguigang/sciBASIC 在分布式哈希表网络之中,Peer节点之间进行分布式数据传输都是使用的B编码。B编码格式与JSON编码格式较为相似,均以“键:值”形式存储,我们可以将B编码的字符串整个内容理解为一个经过特殊编码的字典,或者一个近似的JSON。B编码与JSON编码,这两种编码都仅包含有4种最基础的数据类型:字符串类型,数值类型,数组类型与对象字典类型。 Order by Date Name Attachments DHT-dark-all • 416 kB • 156 click 04.06.2021bdecode • […]
估计阅读时长: 10 分钟 https://github.com/xieguigang/sciBASIC 根据积分表达式,微分方程的数值解关键在于微分方程的初值及计算微分方程式在tm(上一时刻)与tm+d(下一时刻)与坐标轴围成面积,若这个面积计算得越准确则得到的数值解也就越精确。微分表达式中与坐标轴围成的面积可表示如下,在实施算法的时候可以结合这个图更加直观点: 从上面的示意图可以看出,一段需要进行面积积分的曲线实际上是由多个梯形构成的多边形。那我们实际上只需要将这些梯形的面积都求出来,然后加起来就好了。 这里的梯形分割就是一种欧拉逼近的思想,欧拉逼近的几何意义,就是我们可以使用一段折线来近似的逼近一条曲线。 利用欧拉逼近,我们可以将一个精确的微分方程曲线 近似的使用线段来表示 Order by Date Name Attachments ODE_Trapezoidal • 30 kB • […]
binary tree clustering of phenotypic
估计阅读时长: 4 分钟 https://github.com/xieguigang/bclusterTree 对于二叉树,大家肯定不会陌生。二叉树其实就是一个有向无环图(有向:访问的方向是从父节点指向子节点;无环:子节点不会成为其父辈节点的父节点),大家可以从根节点一直往下访问到任意一个叶节点;节点间的方向是根据键值的比较的大小结果来建立的,大的值在右边,小的值在左边(《左迁与右迁》),零值在当前节点。 二叉树示意图来自于这篇博文《Self-balanced Binary Search Trees with AVL in JavaScript》 Order by Date Name Attachments Rplot […]
博客文章
May 2024
S M T W T F S
 1234
567891011
12131415161718
19202122232425
262728293031  
  1. 针对图对象进行向量化表示嵌入: 首先,通过node2vec方法,将node表示为向量 第二步,针对node向量矩阵,进行umap降维计算,对node进行排序,生成node排序序列 第三步,针对node排序序列进行SGT序列图嵌入,实现将网络图对象嵌入为一维向量