估计阅读时长: 8 分钟https://github.com/rsharp-lang/NRRD NRRD(Nearly Raw Raster Data)是一种用于存储类似于热图成像数据的文件格式。其实我们可以将NRRD看作为类似于bitmap之类的未压缩的原始光栅图像文件。只要我们有对应的解码方式,我们就可以像查看普通图片文件一样查看NRRD文件。 Order by Date Name Attachments raster__238 • 61 kB • 245 […]
估计阅读时长: < 1 分钟Order by Date Name Attachments HEStainModelPreviews • 361 kB • 270 click 2022年6月3日13546516212177 • 152 kB […]
估计阅读时长: 10 分钟https://github.com/xieguigang/ms-imaging Order by Date Name Attachments HR2MSI_mouse_urinary_bladder_S096_RGB • 7 MB • 302 click 2021年11月13日peerj-cs-07-585 • 16 […]
估计阅读时长: 11 分钟https://github.com/xieguigang/ms-imaging Mass spectrometry imaging ( MSI) is a technique used in mass spectrometry to visualize the […]
估计阅读时长: 10 分钟Ascii art是一种使用连续排列的ascii字符进行图形设计的技术。它可以显示在任意的文本框中。ascii art出现于上世纪70年代,最初是当时电脑显示技术不发达时用于显示简单图像的一种娱乐。后来逐渐流行开来,有了专门以此为兴趣的艺术家和研究者。 Order by Date Name Attachments 1537192287563 • 50 kB • 313 click 2021年10月1日ASCII-bilibili […]
HR2MSI mouse urinary bladder S096 - spatial regions
估计阅读时长: 11 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 最近在研究实现空间代谢组学中的一些特征区域的自动化划分分割。在得到了特征点集合之后,我们需要根据一些图像处理算法进行特征区域的提取操作。之前,我们尝试过基于绘制等高线图Marching Squares算法的方式来将特征点集合自动转换为特征区域的多边形,实现轮廓扫描获取的功能。但是实现的效果嘛,和实际的区域存在着一些较大的差异。 Order by Date Name Attachments HR2MSI mouse urinary bladder S096 - spatial regions […]
估计阅读时长: 15 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 最近在空间代谢组学中的质谱成像应用开发过程中,会需要使用到一些图像处理算法对原始的质谱成像结果图片进行诸如平滑,放大等处理。顺着图像平滑的算法搜索,通过搜索引擎找到了一个年代比较久远的图像处理算法博客文章,将其中的图像算法重新实现了一下,在这里分享给大家。 Order by Date Name Attachments lena • 558 kB • 282 click 2021年9月10日lenalena • […]
博客文章
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  1. […] 在完成了仿真计算后,针对得到的计算结果文件,接下来我们就可以通过dump_stream函数将计算得到的每一帧的数据以热图的形式导出来,在指定的文件夹中生成每一帧的数据热图结果。在进行热图渲染的时候,可以参考之前写的讲解颜色调色板的文章中列举出来的颜色版进行热图的颜色设置。 […]

  2. […] 这个时候,可能你就会惊呼了,这怎么可能,我们通过ssh远程上去的Linux终端就是一个纯文本组成的命令行,怎么可能直接显示图片呢。只要思想不滑坡,办法总是有的。可能你之前会了解过通过ASCII Art的方式在Linux终端上显示图像:对于ASCII Art方式,我们会将不同像素点的亮度信息(或者说灰度信息)映射到占据不同显示面积的字符上,从而组成了一副可以显示灰度差异的黑白字符画。这个方法可以解决我们的一部分显示需求,但是不多。 […]