MS-Imaging in mzkit software
估计阅读时长: 3 分钟 http://mzkit.org/ 质谱成像是以质谱技术为基础的成像方法,该方法通过质谱直接扫描生物样品成像,可以在同一张组织切片或组织芯片上同时分析数百种分子的空间分布特征。 Order by Date Name Attachments HR2MSI mouse urinary bladder S096 - optical image • […]
估计阅读时长: 3 分钟 原始数据相关的 名词 全称 中文名 含义 mz mass to charge ratio 质荷比 精确分子质量与离子的电荷数量的比值。 rt retention time 保留时间 […]
估计阅读时长: 5 分钟 https://github.com/xieguigang/mzkit SMILES字符串是一种在计算化学领域内使用线性ASCII字符串描述一个具有空间立体结构的分子结构所使用的一种语言规范。因为在工作中会需要使用到SMILES字符串做一些分子结构相关的数据建模分析,所以编写了一个很方便的用于SMILES字符串解析操作的模块,在这篇文章中为大家讲解具体的工作原理。 Order by Date Name Attachments science-connection-structure-with-molecules-simple-modern-white-background-illustration_46577-719 • 36 kB • 89 click 09.06.2021abstract-molecules-structure-with-connect-spherical-particles_46577-689 • […]
估计阅读时长: 2 分钟 https://github.com/xieguigang/mzkit 在BILIBILI上观看视频:《【BioNovoGene Mzkit教程】代谢组学原始数据处理基础》 Order by Date Name Attachments profile_videocard • 211 kB • 90 click 29.05.2021metabolims […]
估计阅读时长: 3 分钟 根据工作的需要,我为R#脚本解释器添加了一个符号计算的功能,这个符号语言特性在进行一些化学信息学分析的时候会非常有用。例如,我们在分析一些天然产物的质谱数据的时候,会需要通过母离子减掉一些糖来进行中性丢失的计算,基于中性丢失计算来进行一些解谱分析操作。在这个过程之中,化学式符号计算就可以派上很大用场了。假设我们有一个天然产物Cyanidin 3-glucoside-5-(6-p-coumaroylglucoside),从名称我们就可以看出这个天然产物是由一个Cyanidin母核,加上两个葡萄糖以及一个coumaroyl基团构成。这个天然产物的分子化学式为C36H37O18,那现在我们将这个化学式输入到R#解释器之中,按下回车就可以很清楚的了解到这个化学式的元素构成 > C36H37O18 757.1979802 (C:36, H:37, O:18) 如果想要使用这个特性,需要在R#终端上导入mzkit程序包模块:imports "formula" from "mzkit"; Order by Date Name […]