估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/rsharp-lang/Rserver 在R语言之中,存在有一个FastRWeb的框架可以将R语言编写的脚本以http服务的方式运行于后台,供其他的语言进行调用。在R#语言之中,我也模仿着R语言之中的FastRWeb框架,创建了一个用于R#语言的web服务的程序包框架。 Order by Date Name Attachments httpr_commandline • 28 kB • 482 click 2021年6月16日http_PUT_test • […]
估计阅读时长: 12 分钟https://github.com/biocad-cloud/web HTTP协议(Hypertext Transfer Protocol)是建立在TCP协议基础上的一种文件传输协议。 Order by Date Name Attachments https-secure-webpages_waifu2x_art_noise3_scale_tta_1 • 770 kB • 491 click […]
估计阅读时长: 6 分钟https://github.com/xieguigang/linux-profiler 废话不多说,首先给出一个 demo报告链接 给大家看看这个小工具的成品输出。 在去年的工作中,因为公司需要购买新的服务器做集群计算,需要一个工具来记录之前的服务器在数据分析上的性能瓶颈。于是花了两天的时间赶出来了这个专门应用于Linux系统的性能记录工具。这个小工具是一个开源项目,大家可以在Github上阅读这个开源项目(linux-profiler)的源代码。 Order by Date Name Attachments systemLoad • 53 kB • 553 […]
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序,由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大,所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中,分为两种模式:线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式,我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考: 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
估计阅读时长: 9 分钟前段时间由于工作的需要,会需要从一些网站上抓取数据用来做数据分析。在原来我进行网页爬虫开发的时候,一般会需要专门针对网页格式,使用大量的正则表达式进行内容的解析。由于你也知道,VisualBasic语言所开发的程序为一个编译好的Assembly文件,所以假若所需要爬取的网页格式变化了,我们就需要对代码做修改和重新编译。这个时候就会非常的不方便。 Order by Date Name Attachments ea5d2885-bba5-410f-b02b-0589613412ed • 12 kB • 540 click 2021年5月29日graphquery_Rscript • 36 […]

[…] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在KEGG数据库的同源注释算法中,BHR的核心思想是“双向最佳命中”。它比简单的单向BLAST搜索(例如,只看你的基因A在数据库里的最佳匹配是基因B)更为严格和可靠。在基因注释中,这种方法可以有效减少因基因家族扩张、结构域保守等原因导致的假阳性注释,从而更准确地识别直系同源基因,而直系同源基因通常具有相同的功能。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后,发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式: […]
不常看到, 没有多余矫饰的表达。敬意。
[…] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后,发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式: […]
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