估计阅读时长: 15 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 最近在空间代谢组学中的质谱成像应用开发过程中,会需要使用到一些图像处理算法对原始的质谱成像结果图片进行诸如平滑,放大等处理。顺着图像平滑的算法搜索,通过搜索引擎找到了一个年代比较久远的图像处理算法博客文章,将其中的图像算法重新实现了一下,在这里分享给大家。 Order by Date Name Attachments lena • 558 kB • 599 click 2021年9月10日lenalena • […]
估计阅读时长: 16 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 等高线指的是地形图上高程相等的相邻各点所连成的闭合曲线。把地面上海拔高度相同的点连成的闭合曲线,并垂直投影到一个水平面上,并按比例缩绘在图纸上,就得到等高线。 Order by Date Name Attachments 1_Contour • 487 kB • 807 click 2021年6月30日Ms1Contour • […]
估计阅读时长: 3 分钟http://mzkit.org/ 质谱成像是以质谱技术为基础的成像方法,该方法通过质谱直接扫描生物样品成像,可以在同一张组织切片或组织芯片上同时分析数百种分子的空间分布特征。 Order by Date Name Attachments HR2MSI mouse urinary bladder S096 - optical image • […]
估计阅读时长: 13 分钟https://github.com/xieguigang/voyager-1 旅行者一号是一艘由NASA在1977年9月5日发射的宇宙飞船,其只比旅行者2号晚16天发射。旅行者一号除了担负着研究我们的太阳系的任务之外,在这艘飞船之上还搭载着一张我们尝试对外界介绍我们的文明的一张名片为“地球之音”的铜质镀金激光唱片,这张金唱片承载着人类与宇宙星系沟通的使命。 Order by Date Name Attachments 1080px-The_Sounds_of_Earth_Record_Cover_-_GPN-2000-001978 • 330 kB • 742 click 2021年6月18日scripting • […]

[…] 基于之前的一篇文章《TF-IDF与N-gram One-hot文档嵌入算法原理》的学习,我们了解到可以将生物序列通过分解为kmer,组成单词集合用来表示一个文档。从而将长度各异的生物序列嵌入为长读一致的数值向量,进而可以用于后续的各种数据处理工作中。在这里,假设我们将基因组中的所有基因提取出来,然后通过blast比对的方式将基因注释到对应的ec number编号,既可以将某一个基因组使用一个ec number的集合来表示。通过这样子的数据表示方法,我们就可以将任意一个大小各异,基因组成不同的基因组都嵌入为具有相同维度特征的数值向量用于机器学习建模之类的工作。 […]
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起了个头而已,等后续更新🤣
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