估计阅读时长: 9 分钟 因为一种单一的编程语言并不会覆盖到所有的适用场景的原因，在一个软件工程项目之中，采用多种语言进行混合编程是一种很常见的协作方式。例如，脚本化的语言，其非常适合于进行最顶层的应用开发，就像胶水一样用于将各种组件进行粘贴，但是脚本化的语言自身因为是基于其他的语言所构建，所以执行效率一般不会太好。对于底层组件，我们一般就会需要使用静态编译类型的非托管语言创建用于高性能数据处理的模块。对于这种需求的底层模块，我们一般可以采用C/C++/Rust来编写。 Order by Date Name Attachments rust • 162 kB • 56 click 25.03.2023dyn-load • 67 […]
估计阅读时长: 15 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism NetCDF文件格式（Network Common Data Format）是一种以network byteorder进行编码的CDF数据文件格式。其广泛应用于大气科学、水文、海洋学、环境模拟、地球物理等诸多数据科学计算分析领域内的数据存储。 Order by Date Name Attachments netcdf • 2 MB • […]
估计阅读时长: 8 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism 对于LINQ数据查询引擎而言，其可以接收任意类型的数据源，进行数据查询。只要存在有相对应的数据源驱动程序即可。 Order by Date Name Attachments sqlite • 18 kB • 154 click 19.06.2021sqlite-contents • […]
估计阅读时长: 11 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism LINQ（Language Integrated Query）技术是一种语言集成查询，即LINQ是VisualBasic语言之中的一种语法。其由微软公司于.NET Framework 3.5引入的一种SQL查询语言非常相似的数据查询语法。 Order by Date Name Attachments query • 51 kB • […]
估计阅读时长: 6 分钟 https://github.com/xieguigang/linux-profiler 废话不多说，首先给出一个 demo报告链接 给大家看看这个小工具的成品输出。 在去年的工作中，因为公司需要购买新的服务器做集群计算，需要一个工具来记录之前的服务器在数据分析上的性能瓶颈。于是花了两天的时间赶出来了这个专门应用于Linux系统的性能记录工具。这个小工具是一个开源项目，大家可以在Github上阅读这个开源项目(linux-profiler)的源代码。 Order by Date Name Attachments systemLoad • 53 kB • 144 […]
估计阅读时长: 5 分钟 https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序，由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大，所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中，分为两种模式：线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式，我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考： 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
waiting and waiting.
Cool + for the post
老师提到的这个问题，我这几天会写一个使用教程，老师后面可以用教程中对应的demo示例来了解下功能的使用
空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗？我试了试，不是10X结果中的tissue_positions_list.csv（软件选择此文件，直接error）；在默认结果中也没找到类似的文件；
目前软件上提供了用于手动关联空间转录组数据和空间代谢组数据的功能，使用具体的功能可以通过成像画布上通过右键菜单依次打开【Samples】->【Add Spatial Tile】加载Space Ranger的空间斑点结果：在软件上进行手动旋转调整位置完成两个空间组学之间的空间位置关联，然后老师这边拿到空间位置关联信息后，就可以按照斑点的空间位置对应关系导出表达数据做关联分析了