Posts on March 17, 2022

VeTra: a tool for trajectory inference based on RNA velocity

【单细胞分析方法】VeTra：基于RNA速度的轨迹推断工具

谢桂纲 -
8:09 PM
估计阅读时长: 5 分钟 单细胞轨迹可以揭示基因调控如何控制细胞命运：大多数细胞状态转变，无论是在发育，重编程或者是疾病异常状态，都以基因表达变化的级联为特征。 Order by Date Name Attachments vec • 722 kB • 223 click 17.03.2022Slide10 • 14 […]
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  1. 针对图对象进行向量化表示嵌入： 首先，通过node2vec方法，将node表示为向量 第二步，针对node向量矩阵，进行umap降维计算，对node进行排序，生成node排序序列 第三步，针对node排序序列进行SGT序列图嵌入，实现将网络图对象嵌入为一维向量