估计阅读时长: 14 分钟https://github.com/rsharp-lang/ggplot 在完成了前面所提到的ANOVA检验模块的代码开发编写工作之后,之前一直悬在我心里面的完善R#语言的ggplot统计作图功能的愿望现在终于实现了。在R#语言之中通过使用ggplot代码库进行相应的数据统计分析作图,目前已经变得和R语言之中的ggplot2程序包那样同样的简单和漂亮。 Order by Date Name Attachments myeloma_bar • 196 kB • 509 click 2022年5月29日myeloma_box • […]

哈哈,Thanks♪(・ω・)ノ
哈哈。这个R程序包用来做代谢组数据的biomarker分析确实挺方便的呢
This clarifies everything perfectly.
其实,你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中,基因的特征数量可能会非常多,做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次,例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次,或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征,得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。
Thanks for taking the time to create this.