Figure 3. MetaMapp of the metabolic modules that were altered in E. coli grown in galactose.
估计阅读时长: 5 分钟 在工作之中可能会遇到需要进行两个网络图对象之间的相似度计算的情形:例如在质谱数据分析的化学信息学计算工作之中,我们在解析SMILES字符串得到分子图之后,可以基于图相似度比较计算方法来比较计算两个代谢物分子图之间的结构上的相似度。 Attachments pone.0078360.g003 • 2 MB • 94 click 06.08.2022https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0078360
binary tree clustering of phenotypic
估计阅读时长: 4 分钟 https://github.com/xieguigang/bclusterTree 对于二叉树,大家肯定不会陌生。二叉树其实就是一个有向无环图(有向:访问的方向是从父节点指向子节点;无环:子节点不会成为其父辈节点的父节点),大家可以从根节点一直往下访问到任意一个叶节点;节点间的方向是根据键值的比较的大小结果来建立的,大的值在右边,小的值在左边(《左迁与右迁》),零值在当前节点。 二叉树示意图来自于这篇博文《Self-balanced Binary Search Trees with AVL in JavaScript》 Order by Date Name Attachments Rplot […]
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  1. 查询字符串以["起始,以"]结尾: SELECT * FROM biodeepdb_full.metabolite WHERE INSTR(name, '["') = 1 AND INSTR(name, '"]') = LENGTH(name) - LENGTH('"]') + 1 ORDER…

  2. 删除mysql表中重复的行数据 ``` delete t1 from metabolite t1 where t1.id in (select t2.id from (select id, `name`, formula, hashcode2, row_number() over(partition…