估计阅读时长: 11 分钟在进行热图的渲染的时候,我们需要首先将需要进行渲染的数据转换为一个0到1之间的灰度值,然后基于所设定的颜色列表,将灰度值映射为颜色列表的索引号,获取某一个灰度对应的颜色,从而完成对热图的渲染过程。在这个过程中,假若我们是针对热图需要获取得到一个连续的颜色列表,则我们还需要使用插值算法针对基础的关键颜色列表进行插值计算,生成调色板。 Order by Date Name Attachments volcano_ggthemes_Traffic • 17 kB • 238 click 2025年6月12日volcano_ggthemes_excel_Ion_Boardroom • 15 […]
估计阅读时长: 11 分钟给定一组n个字符串数组,找到包含给定集合中每个字符串的最小字符串作为子字符串。我们可以假设这个字符串数组中没有字符串是另一个字符串的子字符串。那么基于上面的描述,我们就可以得到下面所示的问题求解目标: let arr[] = ["catg", "ctaagt", "gcta", "ttca", "atgcatc"] // output: gctaagttcatgcatc 上面的问题描述实际上是一个最短超字符串问题(shortest common superstring) Order […]
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  1. 其实,你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中,基因的特征数量可能会非常多,做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次,例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次,或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征,得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。