估计阅读时长: 4 分钟 在代谢组学领域内，LCMS原始数据分析一般分为非靶向全扫原始数据，以及仅针对某些离子进行扫描的MRM靶向质谱数据。虽然二者都是基于LCMS方法进行实验，但是MRM靶向数据由于在事先已经通过实验确定，得到了Q1和Q3离子对信息，所以可以仅针对某一些特定代谢物进行检测。因为MRM数据是针对于某些代谢物检测的靶向数据，所以其XIC谱图在没有同分异构体存在的情况下，一般是很纯净的目标化合物的检测结果数据。所以在原始数据分离，定量计算方面都要比非靶向全扫结果数据要容易很多。 Order by Date Name Attachments xcms-logo-white • 183 kB • 102 click 01.07.2022lcmspreproc_slides_1.2 • 136 […]
估计阅读时长: 2 分钟 https://mzkit.org/ 代谢组文章整个坎坷的发表经历中，大家可能都会遇到的一个老大难问题就是我们有时候会需要从原始数据中得到物质注释结果的二级质谱图数据。对于熟悉xcms程序包的同学，获取二级质谱图可能会比较容易：无非就是加载原始数据，然后按照m/z和rt找到对应的二级scan就好了。但是，这种方法会需要编写脚本来完成。 Order by Date Name Attachments download • 33 kB • 137 click 04.08.2021[278][MS_MS] FTMS […]
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查询字符串以["起始，以"]结尾： SELECT * FROM biodeepdb_full.metabolite WHERE INSTR(name, '["') = 1 AND INSTR(name, '"]') = LENGTH(name) - LENGTH('"]') + 1 ORDER…
删除mysql表中重复的行数据 ``` delete t1 from metabolite t1 where t1.id in (select t2.id from (select id, `name`, formula, hashcode2, row_number() over(partition…
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