Metavirome network
估计阅读时长: 11 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC Louvain算法是基于模块度的网络节点集群发现算法。该算法在效率和效果上都表现较好,并且能够发现层次性的网络节点集群结构,其优化目标是最大化整个网络集群模块的模块度(Modularity)。 Order by Date Name Attachments graph • 2 MB • 416 click 2021年8月7日Metavirome network […]
估计阅读时长: < 1 分钟https://github.com/xieguigang/codegraph Attachments Microsoft.VisualBasic.Framework_v47_dotnet_8da45dcd8060cc9a.dll • 10 MB • 332 click 2021年8月29日
估计阅读时长: 7 分钟https://github.com/xieguigang/mzkit SMILES字符串是一种在计算化学领域内使用线性ASCII字符串描述一个具有空间立体结构的分子结构所使用的一种语言规范。因为在工作中会需要使用到SMILES字符串做一些分子结构相关的数据建模分析,所以编写了一个很方便的用于SMILES字符串解析操作的模块,在这篇文章中为大家讲解具体的工作原理。 Order by Date Name Attachments science-connection-structure-with-molecules-simple-modern-white-background-illustration_46577-719 • 36 kB • 425 click 2021年6月9日abstract-molecules-structure-with-connect-spherical-particles_46577-689 • […]
binary tree clustering of phenotypic
估计阅读时长: 4 分钟https://github.com/xieguigang/bclusterTree 对于二叉树,大家肯定不会陌生。二叉树其实就是一个有向无环图(有向:访问的方向是从父节点指向子节点;无环:子节点不会成为其父辈节点的父节点),大家可以从根节点一直往下访问到任意一个叶节点;节点间的方向是根据键值的比较的大小结果来建立的,大的值在右边,小的值在左边(《左迁与右迁》),零值在当前节点。 二叉树示意图来自于这篇博文《Self-balanced Binary Search Trees with AVL in JavaScript》 Order by Date Name Attachments Rplot […]
博客文章
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  1. ご提供いただきましたこの研究ツールに心より感謝申し上げます。お示しいただいたサンプルコードから見ますと、この方法は非常に使いやすいようです。しかし、実際のデータに適用する際、アルゴリズムがシングルスレッドであるため、大規模な空間代謝組学の生データを可視化する場合、計算プロセスが非常に長時間に及ぶ可能性があります。マルチスレッド計算を可能にした最適化版をご提供いただければ、使用体験が大幅に向上すると思われます。以上、私の個人的な使用感でございます。

  2. Je pense que cet algorithme présente encore des limitations importantes. Par exemple, sur plusieurs poules présentes sur l'image originale, l'une…