估计阅读时长: 15 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism NetCDF文件格式（Network Common Data Format）是一种以network byteorder进行编码的CDF数据文件格式。其广泛应用于大气科学、水文、海洋学、环境模拟、地球物理等诸多数据科学计算分析领域内的数据存储。 Order by Date Name Attachments netcdf • 2 MB • […]
估计阅读时长: 8 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism 对于LINQ数据查询引擎而言，其可以接收任意类型的数据源，进行数据查询。只要存在有相对应的数据源驱动程序即可。 Order by Date Name Attachments sqlite • 18 kB • 535 click 2021年6月19日sqlite-contents • […]
估计阅读时长: 11 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism LINQ（Language Integrated Query）技术是一种语言集成查询，即LINQ是VisualBasic语言之中的一种语法。其由微软公司于.NET Framework 3.5引入的一种SQL查询语言非常相似的数据查询语法。 Order by Date Name Attachments query • 51 kB • […]
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序，由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大，所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中，分为两种模式：线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式，我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考： 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
[…] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在KEGG数据库的同源注释算法中，BHR的核心思想是“双向最佳命中”。它比简单的单向BLAST搜索（例如，只看你的基因A在数据库里的最佳匹配是基因B）更为严格和可靠。在基因注释中，这种方法可以有效减少因基因家族扩张、结构域保守等原因导致的假阳性注释，从而更准确地识别直系同源基因，而直系同源基因通常具有相同的功能。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后，发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式： […]
不常看到, 没有多余矫饰的表达。敬意。
[…] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后，发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式： […]
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