估计阅读时长: 7 分钟 https://github.com/xieguigang/mzkit SMILES字符串是一种在计算化学领域内使用线性ASCII字符串描述一个具有空间立体结构的分子结构所使用的一种语言规范。因为在工作中会需要使用到SMILES字符串做一些分子结构相关的数据建模分析,所以编写了一个很方便的用于SMILES字符串解析操作的模块,在这篇文章中为大家讲解具体的工作原理。 Order by Date Name Attachments science-connection-structure-with-molecules-simple-modern-white-background-illustration_46577-719 • 36 kB • 170 click 09.06.2021abstract-molecules-structure-with-connect-spherical-particles_46577-689 • […]
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  1. 空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗?我试了试,不是10X结果中的tissue_positions_list.csv(软件选择此文件,直接error);在默认结果中也没找到类似的文件;

  2. 目前软件上提供了用于手动关联空间转录组数据和空间代谢组数据的功能,使用具体的功能可以通过成像画布上通过右键菜单依次打开【Samples】->【Add Spatial Tile】加载Space Ranger的空间斑点结果:在软件上进行手动旋转调整位置完成两个空间组学之间的空间位置关联,然后老师这边拿到空间位置关联信息后,就可以按照斑点的空间位置对应关系导出表达数据做关联分析了