估计阅读时长: 11 分钟在进行热图的渲染的时候,我们需要首先将需要进行渲染的数据转换为一个0到1之间的灰度值,然后基于所设定的颜色列表,将灰度值映射为颜色列表的索引号,获取某一个灰度对应的颜色,从而完成对热图的渲染过程。在这个过程中,假若我们是针对热图需要获取得到一个连续的颜色列表,则我们还需要使用插值算法针对基础的关键颜色列表进行插值计算,生成调色板。 Order by Date Name Attachments volcano_ggthemes_Traffic • 17 kB • 6 click 2025年6月12日volcano_ggthemes_excel_Ion_Boardroom • 15 […]
估计阅读时长: 10 分钟  https://github.com/rsharp-lang/athena 在这博客篇文章中的Idea来自于最近进行AI Agent的开发:希望可以有一个方便的框架,能够让我像写普通的R#程序包的方式,为大语言模型编写对应的工具包,实现AI Agent功能。经过了大概一天的摸索,搞定了这样子的AI Agent的框架。我将这个框架取名为雅典娜系统。关于这个系统的名称,我们首先来看看DeepSeek是怎么说的: “我现在正在开发一个和大语言模型助手相关的工具,这个工具可以完成通过自然语言聊天的方式调用相应的工具完成生信数据分析,我需要为这个项目取一个名称,要求这个项目的名称应该是符合下面的需求的:女孩英文名称,和智慧相关的,和科学相关的。为我列举一些候选名称” 根据你的需求(女孩英文名、智慧与科学相关),结合搜索结果中的历史文化名人和寓意,以下是推荐的候选名称及来源解析: 名字 寓意 关联 Athena 源自希腊神话的智慧女神,象征智慧与科学战略。 雅典娜不仅是智慧化身,也代表理性思维,适合强调数据分析与策略的项目。 Clara 拉丁语“明亮、清晰”,象征清晰的科学思维。 […]
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/xieguigang/scale_colour_genshin 在用R绘图时,颜色设置是美化过程中不可缺少的一步。在实际绘图时,一般不会一一手动寻找合适的颜色,而是通过一些R包、网站提供好的,美观的颜色组合,即调色板(palette),可供使用。在这里介绍一种通过提取图片主题色的方法来为我们自动生成画图所用的颜色板数据。 Order by Date Name Attachments 383807b4 • 132 kB • 205 click 2023年4月8日faruzan • […]
估计阅读时长: 9 分钟因为一种单一的编程语言并不会覆盖到所有的适用场景的原因,在一个软件工程项目之中,采用多种语言进行混合编程是一种很常见的协作方式。例如,脚本化的语言,其非常适合于进行最顶层的应用开发,就像胶水一样用于将各种组件进行粘贴,但是脚本化的语言自身因为是基于其他的语言所构建,所以执行效率一般不会太好。对于底层组件,我们一般就会需要使用静态编译类型的非托管语言创建用于高性能数据处理的模块。对于这种需求的底层模块,我们一般可以采用C/C++/Rust来编写。 Order by Date Name Attachments rust • 162 kB • 195 click 2023年3月25日dyn-load • 67 […]
估计阅读时长: 8 分钟https://github.com/rsharp-lang/NRRD NRRD(Nearly Raw Raster Data)是一种用于存储类似于热图成像数据的文件格式。其实我们可以将NRRD看作为类似于bitmap之类的未压缩的原始光栅图像文件。只要我们有对应的解码方式,我们就可以像查看普通图片文件一样查看NRRD文件。 Order by Date Name Attachments raster__238 • 61 kB • 208 […]
估计阅读时长: 5 分钟在BILIBILI上观看视频:《【BioNovoGene Mzkit教程】代谢组学原始数据处理基础》 最近我在B站的视频页面下发现了这样的一条评论,面对质谱数据分析领域内的初学者的求教,其实自己也是非常的诚惶诚恐的。因为在视频中所使用的脚本语言是自己开发的一门新语言,所以可能给一些初学者造成了一部分的困扰哈哈😅😄😅😅。首先先对这个粉丝说一声抱歉哈。 针对上述的提问,我的回答大概是有以下的几点: Order by Date Name Attachments question_20230223 • 17 kB • 170 click […]
Figure 3. MetaMapp of the metabolic modules that were altered in E. coli grown in galactose.
估计阅读时长: 5 分钟在工作之中可能会遇到需要进行两个网络图对象之间的相似度计算的情形:例如在质谱数据分析的化学信息学计算工作之中,我们在解析SMILES字符串得到分子图之后,可以基于图相似度比较计算方法来比较计算两个代谢物分子图之间的结构上的相似度。 Attachments pone.0078360.g003 • 2 MB • 292 click 2022年8月6日https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0078360
估计阅读时长: 31 分钟Like the original R language it does, the R# system just provides a runtime to running […]
估计阅读时长: 69 分钟Read on CodeProject: https://www.codeproject.com/Articles/5338916/Introducing-Rsharp-language With many years of do scientific computing works by VB.NET language, I'm […]
估计阅读时长: 7 分钟https://github.com/rsharp-lang/ggplot 在进行复杂关系的数据集进行可视化的时候,通过网络图的方式进行数据可视化可以让我们非常直观的借助于网络节点的聚集程度之类的布局信息了解到我们的复杂数据的关系结构信息。最近将R#语言之中的ggplot包进行网络可视化的代码库进行了一些更新。基于此功能更新工作,目前在ggplot程序包之中成功集成了ggraph程序包类似的网络可视化功能。在这里做了一些总结分享给大家。 Order by Date Name Attachments enrichNetwork_ggraph • 70 kB • 221 click 2022年6月1日enrichNetwork_ggraph2 • […]
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