估计阅读时长: 7 分钟一般而言，进行全基因组的转录表达调控网络的建立，我们需要基于两个数据结果来完成： 目标基因的转录调控位点信息（Motif搜索结果，构成网络之中的节点） 转录调控位点相应的转录调控因子（Motif位点相关的转录调控因子，构成网络之中的边连接） Order by Date Name Attachments Xor • 271 kB • 373 click 2022年6月11日An […]
估计阅读时长: 12 分钟Motif是一段典型的序列或者一个结构。一般情况下是指构成任何一种特征序列的基本结构。通俗来讲，即是有特征的短序列，一般认为它是拥有生物学功能的保守序列，可能包含特异性的结合位点，或者是涉及某一个特定生物学过程的有共性的序列区段。比如蛋白质的序列特异性结合位点，如核酸酶和转录因子。 Order by Date Name Attachments Smith-Waterman-Algorithm-Example-Step3 • 8 kB • 377 click 2022年6月7日motifPilesHeatmap-1 • 227 […]
估计阅读时长: 7 分钟F统计量是群体遗传学中由Sewall Wright提出的重要统计量，用于衡量遗传变异在群体中的分布情况。它提供了对群体遗传结构和遗传分化的定量描述。F统计量主要有三种类型：Fis、Fit和Fst，分别反映个体内的、总体的和群体间的遗传分化。F统计量在群体遗传学中通常指的是Fst（Fixation Index，固定指数），它是一个衡量群体间遗传差异的指标。Fst的值范围从0到1，其中0表示群体间没有差异，1表示群体间完全分离。在群体遗传学研究中，Fst常用于评估群体的遗传多样性、群体间的迁移率以及自然选择的压力等。 Order by Date Name Attachments 41598_2021_92984_Fig1_HTML • 2 MB • 429 click 2022年5月28日p1 […]
估计阅读时长: 8 分钟https://gcmodeller.org/ KEGG is a database resource for understanding high-level functions and utilities of the biological system, […]
Could you provide some practical examples of how this R package is used? For instance, how does it perform when…
这个和SQL相比较有什么优势？
ご提供いただきましたこの研究ツールに心より感謝申し上げます。お示しいただいたサンプルコードから見ますと、この方法は非常に使いやすいようです。しかし、実際のデータに適用する際、アルゴリズムがシングルスレッドであるため、大規模な空間代謝組学の生データを可視化する場合、計算プロセスが非常に長時間に及ぶ可能性があります。マルチスレッド計算を可能にした最適化版をご提供いただければ、使用体験が大幅に向上すると思われます。以上、私の個人的な使用感でございます。
大佬厉害
Je pense que cet algorithme présente encore des limitations importantes. Par exemple, sur plusieurs poules présentes sur l'image originale, l'une…