估计阅读时长: 9 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 应用程序管线模式就是我们将执行时间比较长，计算任务比较重量级的代码放到一个新的子进程之中执行。通过子进程进行任务执行的应用程序管线模式在各个操作系统上的大型应用程序中都会涉及到。 Order by Date Name Attachments processexplorer • 206 kB • 386 click 2021年6月26日vs_pipeline • […]
估计阅读时长: 5 分钟https://github.com/xieguigang/Darwinism 最近在做一个代谢组学的数据分析程序，由于需要被分析的质谱原始数据的计算量非常大，所以肯定会需要上并行计算。在并行计算中，分为两种模式：线程并行以及进程并行。 关于如果选择脚本代码的并行模式，我在这里借用了matlab文档网站里面的一张图来给大家做参考： 《Choose Between Thread-Based and Process-Based Environments》 Order by Date Name Attachments super_computing • […]
其实，你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中，基因的特征数量可能会非常多，做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次，例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次，或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征，得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。
Thanks for taking the time to create this.
就是随便看看！
c⌒っﾟДﾟ)っ救命啊，谢老师，我试了下用这个程序包直接跑转录组矩阵，跑了好久都没有结果
Could you provide some practical examples of how this R package is used? For instance, how does it perform when…