FBA knowledge network
估计阅读时长: 7 分钟https://github.com/rsharp-lang/bing-academic 我们在进行一个新的课题项目开始之前,会需要经历过一个开题立项的报告过程。在这个过程之中,我们需要收集与课题相关的信息,例如相关的知识背景信息,建立出一个与课题相关的知识网络。基于此知识网络进行课题的技术相关概念的梳理。 Order by Date Name Attachments v2-8119594eef2838042df8fb5af0523c0c_720w • 126 kB • 452 click 2021年8月15日v2-96d82f034d4084cf1ed6eb4784f36ed4_r • […]
博客文章
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  1. 其实,你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中,基因的特征数量可能会非常多,做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次,例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次,或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征,得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。

  2. 就是随便看看!