估计阅读时长: 10 分钟https://github.com/xieguigang/sciBASIC 根据积分表达式,微分方程的数值解关键在于微分方程的初值及计算微分方程式在tm(上一时刻)与tm+d(下一时刻)与坐标轴围成面积,若这个面积计算得越准确则得到的数值解也就越精确。微分表达式中与坐标轴围成的面积可表示如下,在实施算法的时候可以结合这个图更加直观点: 从上面的示意图可以看出,一段需要进行面积积分的曲线实际上是由多个梯形构成的多边形。那我们实际上只需要将这些梯形的面积都求出来,然后加起来就好了。 这里的梯形分割就是一种欧拉逼近的思想,欧拉逼近的几何意义,就是我们可以使用一段折线来近似的逼近一条曲线。 利用欧拉逼近,我们可以将一个精确的微分方程曲线 近似的使用线段来表示
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  1. 代谢组学那堆名词我上次查资料时也手抄过一页,QC 样本、保留时间、m/z 这些混在一张表里,来回对照着看特别费劲。你这篇把英文缩写和中文解释排在一起,省了我不少翻文献的功夫,尤其是代谢物鉴定那几段。

  2. 文中提出的"能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢?"让我想到一个需要先厘清的问题:把Family层级的分类当作细胞分群标签时,功能相似性与亲缘关系可能会混在一起,图上的聚集未必能直接解释为代谢功能接近。如果借用单细胞分析中的降维流程,是否可以同时标注物种分类和基因组注释完整度,看看分离主要对应哪一种差异?尤其是这里用的是EC注释的TF-IDF矩阵,缺少某项注释究竟代表功能缺失还是未被识别,也可能影响对分群结果的判断。

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