估计阅读时长: 7 分钟F统计量是群体遗传学中由Sewall Wright提出的重要统计量,用于衡量遗传变异在群体中的分布情况。它提供了对群体遗传结构和遗传分化的定量描述。F统计量主要有三种类型:Fis、Fit和Fst,分别反映个体内的、总体的和群体间的遗传分化。F统计量在群体遗传学中通常指的是Fst(Fixation Index,固定指数),它是一个衡量群体间遗传差异的指标。Fst的值范围从0到1,其中0表示群体间没有差异,1表示群体间完全分离。在群体遗传学研究中,Fst常用于评估群体的遗传多样性、群体间的迁移率以及自然选择的压力等。 Order by Date Name Attachments 41598_2021_92984_Fig1_HTML • 2 MB • 563 click 2022年5月28日p1 […]
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  1. […] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在KEGG数据库的同源注释算法中,BHR的核心思想是“双向最佳命中”。它比简单的单向BLAST搜索(例如,只看你的基因A在数据库里的最佳匹配是基因B)更为严格和可靠。在基因注释中,这种方法可以有效减少因基因家族扩张、结构域保守等原因导致的假阳性注释,从而更准确地识别直系同源基因,而直系同源基因通常具有相同的功能。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后,发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式: […]

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