估计阅读时长: 30 分钟零分布(null distribution)是指在假设零假设(null hypothesis)成立的情况下,某个统计量随机取值的概率分布。在统计假设检验中,我们通常提出一个零假设(例如“两组数据没有显著差异”或“观察到的模式仅由随机因素造成”),然后根据观测数据计算一个检验统计量。零分布描述了这个统计量在零假设为真时的分布情况。通过将实际观测到的统计量与零分布进行比较,我们可以计算出P-value:即在零假设下,出现等于或更极端观测结果的概率。如果P-value很小(例如低于预设的显著性水平α),我们就认为零假设不太可能成立,从而拒绝零假设,认为观测结果是统计显著的。
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  1. 代谢组学那堆名词我上次查资料时也手抄过一页,QC 样本、保留时间、m/z 这些混在一张表里,来回对照着看特别费劲。你这篇把英文缩写和中文解释排在一起,省了我不少翻文献的功夫,尤其是代谢物鉴定那几段。

  2. 文中提出的"能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢?"让我想到一个需要先厘清的问题:把Family层级的分类当作细胞分群标签时,功能相似性与亲缘关系可能会混在一起,图上的聚集未必能直接解释为代谢功能接近。如果借用单细胞分析中的降维流程,是否可以同时标注物种分类和基因组注释完整度,看看分离主要对应哪一种差异?尤其是这里用的是EC注释的TF-IDF矩阵,缺少某项注释究竟代表功能缺失还是未被识别,也可能影响对分群结果的判断。

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