估计阅读时长: 7 分钟 热图(Heat Map)是在二维空间中以颜色的形式显示一个现象的绝对量一种数据可视化技术。颜色的变化可能是通过色调或强度,给读者提供明显的视觉提示,说明现象是如何在空间上聚集或变化的。热图有两种完全不同的类别:聚集热图和空间热图。 在聚集热图中,幅度被排列成一个固定单元格大小的矩阵,其行和列是离散的现象和类别,行和列的排序是有意的,而且有些随意,目的是暗示聚集或描绘出通过统计分析发现的聚集。单元格的大小是任意的,但足够大,可以清晰可见。 相比之下,空间热图中某一量级的位置是由该量级在该空间中的位置所决定的,没有单元的概念,现象被认为是连续变化的。 Order by Date Name Attachments 2D-cubic-spline-interpolation-of-mass-profiles-from-1939-to-2354-UT-and-between-16 • 112 kB • 159 click […]
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老师提到的这个问题,我这几天会写一个使用教程,老师后面可以用教程中对应的demo示例来了解下功能的使用
空间Spot结果在下载到的mzkit文件夹中有示例吗?我试了试,不是10X结果中的tissue_positions_list.csv(软件选择此文件,直接error);在默认结果中也没找到类似的文件;
目前软件上提供了用于手动关联空间转录组数据和空间代谢组数据的功能,使用具体的功能可以通过成像画布上通过右键菜单依次打开【Samples】->【Add Spatial Tile】加载Space Ranger的空间斑点结果:在软件上进行手动旋转调整位置完成两个空间组学之间的空间位置关联,然后老师这边拿到空间位置关联信息后,就可以按照斑点的空间位置对应关系导出表达数据做关联分析了