估计阅读时长: 2 分钟脂质组学作为系统生物学和代谢组学的重要分支,近年来取得了长足的发展,已成为生命科学研究中不可或缺的重要工具。 脂质组学的定义与研究内容 脂质组学是系统研究脂质组的一门独立学科,作为大规模定性和定量研究脂类化合物并了解它们在不同生理、病理条件下的功能和变化的方法学,能准确全面地提供生物样品中的脂质信息。它被定义为对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,进而揭示脂质代谢与细胞、器官乃至机体生理病理过程的关系。 脂质是一类具有疏水性并且在大多数情况下可以溶于有机溶剂的物质,当然,还有部分脂质因为带有极性基团,往往是亲水性的,例如磷脂等。脂质组学是对生物体内的脂质进行系统分析的一门新兴学科,是代谢组学的重要分支。基于液质联用技术(LC-MS),无偏向性、尽可能多地检测细胞、组织、器官或体液等生物样本中的脂质。
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  1. 代谢组学那堆名词我上次查资料时也手抄过一页,QC 样本、保留时间、m/z 这些混在一张表里,来回对照着看特别费劲。你这篇把英文缩写和中文解释排在一起,省了我不少翻文献的功夫,尤其是代谢物鉴定那几段。

  2. 文中提出的"能否基于单细胞数据分析方法来分析和可视化我的基因组功能嵌入的结果矩阵呢?"让我想到一个需要先厘清的问题:把Family层级的分类当作细胞分群标签时,功能相似性与亲缘关系可能会混在一起,图上的聚集未必能直接解释为代谢功能接近。如果借用单细胞分析中的降维流程,是否可以同时标注物种分类和基因组注释完整度,看看分离主要对应哪一种差异?尤其是这里用的是EC注释的TF-IDF矩阵,缺少某项注释究竟代表功能缺失还是未被识别,也可能影响对分群结果的判断。

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