估计阅读时长: 2 分钟宏基因组学(Metagenomics)通过直接测序环境样本中的全部DNA,从而避免了传统培养方法的局限,使我们能够研究不可培养微生物的多样性。然而,当样本来自宿主相关环境(如人类或小鼠的肠道、土壤等)时,测序数据中不可避免地包含大量宿主自身的DNA序列。这些宿主序列会占据测序读数,增加分析成本,并可能干扰对微生物群落组成的准确推断。因此,在宏基因组数据分析中,去除宿主序列(Host Sequence Removal)是至关重要的预处理步骤。去除宿主序列的算法多种多样,其中基于k-mer的方法因其高效和可扩展性而备受关注。 Attachments Metagenomics • 211 kB • 2 click 2025年11月29日
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确实少有, 这么高质量的内容。谢谢作者。;-) 我很乐意阅读 你的这个技术博客网站。关于旅行者上的金唱片对外星朋友的美好愿望,和那个时代科技条件限制下人们做出的努力,激励人心。
我目前做的工作主要是发酵计算工具,可能和老师的需求有一些偏差
老师您好,您目前可以直接使用 iNAP 2.0方法 https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.235
谢博,您好,我们课题组目前正在做环境微生物网络相关的课题,搜索github上发现了您最近做的微生物建模工具,请问有合作意向么