Fig. 4 Weighted correlation network analysis (WGCNA) identifies IFNα-regulated mRNA and protein modules
估计阅读时长: 6 分钟微生物全基因组代谢网络(Genome-scale metabolic model, GEM)模型的发展历史可追溯至20世纪90年代。1994年,Varma和Palsson在《Applied and Environmental Microbiology》期刊上发表了开创性论文,题为"Stoichiometric flux balance models quantitatively predict growth and metabolic by-product […]
博客文章
November 2025
S M T W T F S
 1
2345678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
30  
  1. […] 在前面写了一篇文章来介绍我们可以如何通过KEGG的BHR评分来注释直系同源。在KEGG数据库的同源注释算法中,BHR的核心思想是“双向最佳命中”。它比简单的单向BLAST搜索(例如,只看你的基因A在数据库里的最佳匹配是基因B)更为严格和可靠。在基因注释中,这种方法可以有效减少因基因家族扩张、结构域保守等原因导致的假阳性注释,从而更准确地识别直系同源基因,而直系同源基因通常具有相同的功能。在今天重新翻看了下KAAS的帮助文档之后,发现KAAS系统中更新了下面的Assignment score计算公式: […]