估计阅读时长: 6 分钟https://github.com/xieguigang/linux-profiler 废话不多说,首先给出一个 demo报告链接 给大家看看这个小工具的成品输出。 在去年的工作中,因为公司需要购买新的服务器做集群计算,需要一个工具来记录之前的服务器在数据分析上的性能瓶颈。于是花了两天的时间赶出来了这个专门应用于Linux系统的性能记录工具。这个小工具是一个开源项目,大家可以在Github上阅读这个开源项目(linux-profiler)的源代码。 Order by Date Name Attachments systemLoad • 53 kB • 470 […]

其实,你不应该直接跑原始表达矩阵的。因为在原始表达矩阵中,基因的特征数量可能会非常多,做随机森林或者SVM建模就会会非常久。应该先用limma程序包对矩阵筛选一次,例如用log2fc绝对值按照阈值cutoff筛选一次,或者对log2fc绝对值排序后取前1000个特征,得到小一些feature集合的矩阵后再使用这个程序包做机器学习分析。
Thanks for taking the time to create this.
就是随便看看!
c⌒っ゚Д゚)っ救命啊,谢老师,我试了下用这个程序包直接跑转录组矩阵,跑了好久都没有结果
Could you provide some practical examples of how this R package is used? For instance, how does it perform when…