我是一位国产工业软件开发者

Mzkit桌面工作站

Mzkit工作站软件主要是应用于基于核磁共振/质谱数据的化学信息学方面的CAE(计算机辅助工程与计算机辅助分析)数据分析功能。目前已完成对质谱数据以及NMR数据的支持。目前的研发投入主要集中在质谱成像相关功能以及定量计算分析等分析化学相关的功能研发。

Mzkit目前为一款诺米代谢向大家所提供的免费开源的质谱数据分析软件

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我目前所从事的工作是在国内的一家比较大的代谢组学服务公司的高级数据科学家,主要从事一些使用VisualBasic.NET,R/R#语言进行数据科学相关的分析脚本以及流程编写开发工作。如果你对我自己模仿R语言所创建的R#语言做数据分析感兴趣的话,我这个博客网站目前是你进行R#语言学习的最好选择。

估计阅读时长: 8 分钟为了能够稳定的使用Ubuntu系统作为我的测试环境,我专门安装了Ubuntu的2404 LTS版本。但是发现虽然是LTS版本,仍然会因为系统更新而出现各种莫名奇妙的BUG。例如,在今天我为了安装软件,使用apt upgrade更新系统环境之后,出现了下面的消息: Order by Date Name Attachments ubuntu-24-04-noble-numbat • 66 kB • 1 click 2025年6月7日ti8S1 • 66 kB • […]
估计阅读时长: 10 分钟  https://github.com/rsharp-lang/athena 在这博客篇文章中的Idea来自于最近进行AI Agent的开发:希望可以有一个方便的框架,能够让我像写普通的R#程序包的方式,为大语言模型编写对应的工具包,实现AI Agent功能。经过了大概一天的摸索,搞定了这样子的AI Agent的框架。我将这个框架取名为雅典娜系统。关于这个系统的名称,我们首先来看看DeepSeek是怎么说的: “我现在正在开发一个和大语言模型助手相关的工具,这个工具可以完成通过自然语言聊天的方式调用相应的工具完成生信数据分析,我需要为这个项目取一个名称,要求这个项目的名称应该是符合下面的需求的:女孩英文名称,和智慧相关的,和科学相关的。为我列举一些候选名称” 根据你的需求(女孩英文名、智慧与科学相关),结合搜索结果中的历史文化名人和寓意,以下是推荐的候选名称及来源解析: 名字 寓意 关联 Athena 源自希腊神话的智慧女神,象征智慧与科学战略。 雅典娜不仅是智慧化身,也代表理性思维,适合强调数据分析与策略的项目。 Clara 拉丁语“明亮、清晰”,象征清晰的科学思维。 历史上克拉拉·舒曼(音乐家)虽非科学家,但名字的“明亮”特质契合数据分析的精准性。 Rosalind 取自科学家罗莎琳德·富兰克林(Rosalind Franklin),DNA结构发现者。 […]
估计阅读时长: 8 分钟 https://github.com/xieguigang/LLMs 已知,现在我们可以成功的和正在运行的大语言模型服务勾搭了,现在能够让大语言模型为我们做些什么。很遗憾的是,由于大语言模型本质上只是一个数学模型,其作用只是针对我们的输入找出最佳的字符输出组合。如果我们没有额外的针对大语言模型进行拓展,我们所勾搭上的大语言模型充其量也只是一个聊天机器人,他既不能帮我们发送email,也不能够帮助我们调节屋内的灯光,只能够做到分析我们输入的文本,然后输出一段最佳的文本。所以我们需要通过针对大语言模型添加额外的拓展来帮助我们实现各种功能。 又已知,大语言模型的本质就是进行文本的结构化分析,那么假如我们的输入信息中包含有某些工具函数的描述信息,而且大语言模型能够正确的分析出我们的输入文本和输入信息中所包含的工具函数之间的对应关系,那么大语言模型的输出就可以专门定向的变换为一种针对输入信息所对应的函数调用的结构化文本信息输出。当运行大语言模型的基础服务捕捉到这种结构化文本(例如json)输出后就可以通过这种结构化文本信息的内容解析结果来调用对应的外部工具,这样子我们就可以让大语言模型来帮助我们完成特定的任务了。这种特性就是大语言模型的Function Calling功能。

关于创作者

R#语言之父,热衷于各种数据可视化。在代谢组学数据分析和机器学习领域内有着非常丰富的工作经验,大约10年的生物信息学研发工作经验。平时最开心的时候就是可以在工作中重复造各种轮子,并且可以成功的应用于各种商业化项目之中。经过多年的生物信息学和化学信息学领域内的工作,目前手头上已经重复造出了非常多的轮子,积累了大量的代码库,对各种数据分析方法轮子的使用也都非常得心应手。

诺米代谢BioDeep研发中心

谢桂纲 · 高级数据科学家

目前主要从事代谢组学领域内的数据分析方法开发,化学信息学质谱数据分析以及质谱应用研发,生物信息学大数据挖掘,工业软件研发相关的工作。