估计阅读时长: 10 分钟Ascii art是一种使用连续排列的ascii字符进行图形设计的技术。它可以显示在任意的文本框中。ascii art出现于上世纪70年代,最初是当时电脑显示技术不发达时用于显示简单图像的一种娱乐。后来逐渐流行开来,有了专门以此为兴趣的艺术家和研究者。 Order by Date Name Attachments 1537192287563 • 50 kB • 491 click 2021年10月1日ASCII-bilibili […]
估计阅读时长: 7 分钟https://github.com/xieguigang/mzkit SMILES字符串是一种在计算化学领域内使用线性ASCII字符串描述一个具有空间立体结构的分子结构所使用的一种语言规范。因为在工作中会需要使用到SMILES字符串做一些分子结构相关的数据建模分析,所以编写了一个很方便的用于SMILES字符串解析操作的模块,在这篇文章中为大家讲解具体的工作原理。 Order by Date Name Attachments science-connection-structure-with-molecules-simple-modern-white-background-illustration_46577-719 • 36 kB • 503 click 2021年6月9日abstract-molecules-structure-with-connect-spherical-particles_46577-689 • […]

Hello blogger, thank you for sharing this post! We process a large number of metagenomic samples, and every time we…
谢博,您好。阅读了您的博客文章非常受启发!这个基于k-mer数据库的过滤框架,其核心是一个“污染源数据库”和一个“基于覆盖度的决策引擎”。这意味着它的应用远不止于去除宿主reads。 我们可以轻松地将它扩展到其他场景: 例如去除PhiX测序对照:建一个PhiX的k-mer库,可以快速剔除Illumina测序中常见的对照序列。 例如去除常见实验室污染物:比如大肠杆菌、酵母等,建一个联合的污染物k-mer库,可以有效提升样本的纯净度。 例如还可以靶向序列富集:反过来想,如果我们建立一个目标物种(比如某种病原体)的k-mer库,然后用这个算法去“保留”而不是“去除”匹配的reads,这不就实现了一个超快速的靶向序列富集工具吗? 这中基于kmer算法的通用性和扩展性可能会是它的亮点之一。感谢博主提供了这样一个优秀的思想原型
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确实少有, 这么高质量的内容。谢谢作者。;-) 我很乐意阅读 你的这个技术博客网站。关于旅行者上的金唱片对外星朋友的美好愿望,和那个时代科技条件限制下人们做出的努力,激励人心。